甘肃地质博物馆始建于1943年，其前身为地质陈列室，由我国老一辈地质学家王日伦先生创建，是全国最早的地质博物馆之一。整个博物馆总体建制为：内设序厅、地球厅、矿物岩石厅、宝玉石厅、生命演化厅、土地资源厅、地质环境厅、矿产资源厅、4D穹幕影厅和临时展厅，馆外设有矿石林和影雕文化墙。其除了展厅以外，设有五个常规工作管理及运行机构，它们的工作具体内容如下：甘肃地质博物馆下设5个工作机构，即办公室、综合研究部、宣传教育部、展览策划部、藏品管理部。一、办公室负责全馆人事、财务、外事等工作的管理协调；负责各类文件的收、发、归档管理；负责负责全馆各类会议及会务工作；负责组织制定全馆各项规章制度并组织具体实施；负责本馆网站、局域网建设和管理；负责博物馆基建工作；负责编写博物馆大事记；负责图书资料的征订、整理、保管、借阅；负责馆绿化工作；协助做好党、团、妇、工会建设工作；承办上级有关部门和馆领导交办的其它工作。二、综合研究部负责科研项目的立项、实施、成果和报告编写； 负责古生物化石、岩石、矿物标本的野外采集、挖掘和修理工作，以及向社会各方面征集标本；负责博物馆藏品的科学研究、科研成果的发表和出版、组织开展学术讲座；负责科学管理专业技术档案，为研究、出版、收藏、陈列等工作提供使用资料的方便；负责与各类博物馆建立资料交流关系。三、宣传教育部负责博物馆展厅对外开放的日常管理，负责展厅内的基本陈列、专题展览的导览、讲解和咨询；负责科普教育基地等项目的建设及管理 ;负责团队观众的组织开发、接待和票务管理；负责与学校之间的联系，协助相关教育部门进行专业教学服务；开展观众调查和研究工作；负责展厅内多媒体设备的维护、保养；负责全馆的安全保卫工作。四、展览策划部负责制定年度展览规划和特展计划，负责展览的筹备及展出标本管理;负责科普宣传活动的策划与实施; 负责科普宣传资料、书刊的前期策划、编写、印刷、出版和发行；负责与国内外博物馆等相关单位的合作交流;负责与上级业务指导部门的协调与联络等工作；负责与省、市文物局，省、市科协等单位的联系并完成其交办的任务。五、藏品管理部负责国土资源实物标本的收集、鉴定、整理、保管、收藏；负责接收全省行政区域内汇交的地质和土地资料，对其进行整理、建档、保管并为社会提供服务;负责国土资源资料研究和信息化建设工作;负责古生物化石标本的整理、上架工作；负责藏品的接收、鉴定、登帐、编目、建档、保养、修复及相关研究工作;负责实物标本的3D扫描及建立3D影像数据库；负责藏品经常性的维护和拍摄工作，承担藏品出版、陈列的拍照工作。综上所述，可以看出我们整个甘肃地质博物馆中的展厅设置，机构建制内容健全，机构完整，有着极强的组织性及纪律性，人员安排妥当，工资发放到位，建设有效，是国内不可多得的综合性大型地质博物馆。
甘肃地质博物馆下设5个工作机构，即办公室、综合研究部、宣传教育部、展览策划部、藏品管理部。一、办公室负责全馆人事、财务、外事等工作的管理协调；负责组织起草全馆的公文及综合性材料；负责各类文件的收、发、归档管理；负责接转、催办各级领导的批示、建议，并督促、检查贯彻落实和办理情况；负责全馆各类会议及会务工作；负责组织制定全馆各项规章制度并组织具体实施；负责固定资产采购与管理、物品采购及全馆的后勤保障；负责本馆网站、局域网建设和管理；负责车辆管理和驾驶人员的安全教育；负责博物馆大楼的物业管理；负责博物馆基建工作；负责编写博物馆大事记；负责图书资料的征订、整理、保管、借阅；负责馆绿化工作；协助做好党、团、妇、工会建设工作；承办上级有关部门和馆领导交办的其它工作。二、综合研究部负责科研项目的立项、实施、成果和报告编写； 负责古生物化石、岩石、矿物标本的野外采集、挖掘和修理工作，以及向社会各方面征集标本；负责博物馆藏品的科学研究、科研成果的发表和出版、组织开展学术讲座；负责科学管理专业技术档案，为研究、出版、收藏、陈列等工作提供使用资料的方便；负责与各类博物馆建立资料交流关系。三、宣传教育部负责博物馆展厅对外开放的日常管理，负责展厅内的基本陈列、专题展览的导览、讲解和咨询；负责科普教育基地等项目的建设及管理 ;负责团队观众的组织开发、接待和票务管理；负责与学校之间的联系，协助相关教育部门进行专业教学服务；开展观众调查和研究工作；负责展厅内多媒体设备的维护、保养；负责全馆的安全保卫工作。四、展览策划部负责制定年度展览规划和特展计划，负责展览的筹备及展出标本管理;负责科普宣传活动的策划与实施; 负责科普宣传资料、书刊的前期策划、编写、印刷、出版和发行；负责与国内外博物馆等相关单位的合作交流;负责与上级业务指导部门的协调与联络等工作；负责与省、市文物局，省、市科协等单位的联系并完成其交办的任务。五、藏品管理部负责国土资源实物标本的收集、鉴定、整理、保管、收藏；负责接收全省行政区域内汇交的地质和土地资料，对其进行整理、建档、保管并为社会提供服务;负责国土资源资料研究和信息化建设工作;负责古生物化石标本的整理、上架工作；负责藏品的接收、鉴定、登帐、编目、建档、保养、修复及相关研究工作;负责实物标本的3D扫描及建立3D影像数据库；负责藏品经常性的维护和拍摄工作，承担藏品出版、陈列的拍照工作。